Commissaire divisionnaire de police, Valérie Maldonado a réalisé un parcours en police judiciaire diversifié. Après une expérience en service territorial à Lyon puis à Nice sur des dossiers judiciaires liés à la délinquance organisée financière et à la corruption, elle rejoint, en 2011, les offices centraux de la Direction centrale de la police judiciaire à Paris. Elle prend la tête de l’Office central de la lutte contre le faux monnayage (OCRFM) et s’intéresse au démantèlement des trafics internationaux des faux billets en euros. Cinq ans plus tard, elle intègre l’Office central de lutte contre la cybercriminalité (OCLCTIC). C’est en 2014 qu’elle est choisie comme précurseur pour la création de la Sous-direction de la lutte contre la cybercriminalité qui verra le jour en 2014. Elle poursuit alors le développement de projets novateurs parmi lesquels le dispositif national de plainte en ligne pour les escroqueries sur Internet et accompagne et consolide les structures nouvelles qui donnent toute l’ambition de cette nouvelle sous-direction cyber.
Directrice adjointe depuis le 7 janvier 2019, Valérie Maldonado a été nommée directrice de l'INHESJ par décret du Président de la République en date du 13 novembre 2019 et a pris ses fonctions le 18 novembre 2019, et les a quittées à la fermeture de l'établissement public administratif le 31 décembre 2020.